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黨委組織部（黨校）
黨委宣傳部
黨委統戰部
改革與發展研究室（高教研究所）
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校長辦公室
教務處(招生辦公室、教師(教學)發展中心)
教育教學評估中心
研究生院(學科建設辦公室、黨委研究生工作部)
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人文社科處
社會合作與服務處(大學科技園管理委員會辦公室)
繼續教育處(學院)
人事處(教師工作部)
國際合作與交流處(港澳臺辦公室)
學生工作部(處)(畢業生就業指導中心、心理健康教育中心)
財務處
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采購管理辦公室
后勤保障處
保衛部(處)、人武部
基建處
實驗室與設備管理處(測試中心)
信息化建設與管理處
對外聯絡辦公室(校友會、董事會、教育基金會辦公室)
離退休處(關心下一代工作委員會)
附屬醫院
海外教育學院
圖書館
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現代農業科教示范園區建設與管理辦公室（高郵）
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